Author: huang

Abstract: 1. starting R not on the conda base, it caused errors! should firstly deactivate base with | conda deactivate | R | sT_DMSO_042.fastq.gz -> ../220617_NB501882_0371_AH7572BGXM/042_MKL-1_sT_DMSO_EV_

Author: huang

Abstract: https://chat.openai.com/chat write a script, output the first token of every line of a file ``` # Open the file with open("file.txt", "r") as file: # Loop through each line in the file for l

Author: huang

Abstract: Abbreviation: Pathogen - Abau: Acinetobacter baumannii - Acla: Alkalihalobacillus clausii - Afab: Agrobacterium fabrum - Bado: Bifidobacterium adolescentis - Bbac: Bartonella bacilliformis - Bbif: Bi

Author: huang

Abstract: # Long-read sequencing methods - Single molecule real time (SMRT) sequencing --> PACBIO_SMRT - Nanopore DNA sequencing --> OXFORD_NANOPORE # Short-read sequencing methods - Massively parallel sign

Author: huang

Abstract: 抗万古霉素肠球菌（Vancomycin-Resistant Enterococcus，简称VRE），又名万古霉素抗药性肠球菌，是肠球菌属下的一种细菌，有着对万古霉素这种抗生素的抗药性。肠球菌是一种移生在肠道的革兰氏阳性球菌，故名肠球菌。在十九世纪末发现，早期归为链球菌属。在肠球菌属中，对人类有着病原性的有粪肠球菌（Enterococcus faecalis）及屎肠球菌（Enterococcus f

Author: huang

Abstract: 克雷白氏菌(Klebsiella pneumoniae)属肠杆菌科(Enterobacteriaceae)中克雷白氏杆菌(Klebsiella)，分有三个品种为K.Pneumoniae subsp. pneumoniae、K.pneumoniae subsp.ozaenae、K.pneumoniae subsp.rhinoscleromatis，属G (-)兼气性厌氧菌。在人类的感染方面，经统计肺

Author: huang

Abstract: 绿脓杆菌是革兰氏阴性杆菌，因为这种绿脓杆菌对养分的需求少，容易在自然界生长、繁殖，尤其可以抵抗多种杀菌剂、消毒剂或抗生素，是目前院内感染的主要致病菌。绿脓杆菌经常由伤口、烧伤部位、外科手术或治疗、检验用各种插管，甚至使用不当的隐形眼镜，而侵入人体。绿脓杆菌对健康的人威胁不大，但经常侵犯囊状纤维瘤患者，或因烧伤、恶性肿瘤而造成免疫力缺失的人，以及因器官移植而使用了免疫抑制药物的病人。 一旦绿脓杆菌

Author: huang

Abstract: 经常在皮肤中发现的一种良性病毒能够导致一种罕见的致命性皮肤癌。特别地，梅克尔多元癌细胞病毒（Merkel cell polyomavirus, MCPyV）感染能够导致免疫功能受损的个人患上梅克尔细胞癌（Merkel cell carcinoma）。如今，在一项新的研究中，来自美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院等机构的研究人员发现人体中的一类皮肤细胞是MCPyV的入侵靶标。再者，他们建立一种新方法来

Author: huang

Abstract: 呼吸道合胞病毒（Respiratory syncytial virus, RSV）属于副黏病毒科的肺病毒属（Pneumovirus），只有一种血清型 [1] 。主要引起6个月以下婴儿患细支气管炎和肺炎等下呼吸道感染，以及较大儿童和成人的鼻炎、感冒等上呼吸道感染。 形态学 病毒形态为球形，直径为120~300nm， [2] 有包膜，基因组为非分节段的单负链RNA，主要编码10种蛋白质，即融合蛋

Author: huang

Abstract: 人乳头瘤病毒属于乳多空病毒科乳头瘤空泡病毒A属，是球形DNA病毒，能引起人体皮肤黏膜的鳞状上皮增殖。症状表现为寻常疣、生殖器疣（尖锐湿疣）等。 随着性病中尖锐湿疣的发病率急速上升和宫颈癌、肛门癌等的增多，人乳头瘤病毒（HPV）感染越来越引起人们的关注。 2017年10月27日，世界卫生组织国际癌症研究机构公布的致癌物清单初步整理参考，人乳头瘤病毒6和11型、人乳头瘤病毒β属(5和8型除外)和γ属在